重新申請在留資格與過去出席 - 留學

各位版友好，
我目前申請留學生的在留資格
遇到了一點問題，想要請教大家…
我過去在慶應唸過別科，
回台灣一段時間後要回去慶應念大學院

現在慶應在重新申請在留資格證明，
審理後昨天被入國管理局通知：
要再補上過去在別科的成績單跟修業證明書

第一個學期的成績單沒有問題，
但是第二個學期則是因為當初在日本身體狀況不佳，導致出席率低，
因此慶應後來表示：
因為第二學期出席不符合學校規定，
所以不符合發修業證明的資格，

所以其實這樣的話我只能提供成績單，然後別科的人有說會再幫我加送在籍證明以證明我的確有在學過

但我現在非常害怕新申請大學院的在留資格，
入管會覺得當初我出席不佳是因為去打工，
而不發新的在留資格給我…
這樣是不是就無法入學了？

我當初連資格外都沒有申請，
完全沒有去打工@@
在日本生活的資金來源證明也很正常

想請問大家有沒有遇過這種狀況呢>_<
大學院都合格了，入管卻不發簽證下來的case有很多嗎…天哪:(

感謝！！


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